In 1890 is er goedkeuring gegeven voor de bouw van de Sint Johannes de Doperkerk te Wateringen. Het gebouw in neogotische stijl is op 11 juni 1901 ingewijd.
De architecten waren de heren Margry en Snickers uit Rotterdam, leerlingen van de beroemde bouwmeester Cuypers. Deze kruiskerk is opgebouwd volgen de regels van de franse Gotiek. In 13 maanden is de kerk gebouwd door C. Dessing uit Gouda. De kleurrijke gebrandschilderde glas in lood ramen zijn ontworpen en gemaakt door de brandschilder W. van der Wurff, met Bijbelse uitbeeldingen naar ideeën van pastoor Finkenflügel. De kerk heeft een prachtige symbolische uitstraling met Bijbelse uitleg. Niet alles is behouden gebleven, veel beelden zijn weg en muurschilderingen waren aangetast. Gelukkig is er nog heel veel bewaard gebleven. De St. Jan, gebouwd op een eiland aan de Gantel, heeft nog niets aan pracht verloren. De statige toren van 52 meter hoog heeft ook zijn eigen charme. Hij is in de wijde omtrek te zien.