De kerk werd gebouwd in 1651, maar deze was te klein en werd daarom in 1661 vergroot (dit jaartal staat ook op de gevelsteen). In 1862 werd het kerktorentje vernieuwd en in 1866 kon een klok in de toren worden geplaatst. Pas in 1920 werd in de kerk een orgel geplaatst. Het dateert uit het midden van de 18-de eeuw en is een werkstuk van de orgelmakersfamilie Hildebrandt. Dit orgel kwam in 1870 in de kerk van Eerbeek terecht, vanwaar het in 1920 naar Niezijl ging.

De kerk is eigendom van de Stichting Oude Groninger Kerken.

Expositie
In de kerk is een expositie met werk van Schilderclub Niezijl en Fotogroep InFocus Zuidhorn. Zij stellen werk tentoon met als thema het karakteristieke landschap van Niezijl en omstreken. Blikken van herkenning, gevangen in verf en licht.