Deze gotische kruiskerk heeft een toren uit ca. 1350, een eenbeukig schip van ca. 1425, twee dwarsbeuken en een koor. In het schip met houten gewelf zijn bij een restauratie rond 1920 twee muurschilderingen ontdekt. Toen zijn ook verschillende grafstenen van het kerkhof in de vloer van het schip gelegd. De zijbeuken –het zuider– en noordertransept zijn uit resp.. Ca. 1500 en 1550. Het zuidertransept is gebouwd op de oude graftombe van de Heren van Borsele. Het koor dateert uit de tweede helft van de vijftiende eeuw. Dit koor is versierd met houten apostelbeelden en ander houtsnijwerk.

De middeleeuwse Mariakerk in Nisse bevat meerdere kunstschatten. De meest bijzondere zijn de houten beelden van de twaalf apostelen onderaan de balken die het plafond dragen. Verder zijn er ook muurschilderingen te zien met bijbelse voorstellingen en een van sint Christoffel met het Christuskind op zijn schouder. Ook is er mooi houtsnijwerk te bewonderen.