In 1913 opende het Polderhuis als bestuurscentrum van het waterschap Haarlemmermeerpolder. In de vergaderruimte kwamen de hoogheemraden en de dijkgraaf bijeen om te praten over waterbeheersing en waterkering. De dijkgraaf woonde in de dienstwoning. Tot dan toe werd vergaderd in Haarlem maar dankzij de nieuwe spoorverbinding kreeg Haarlemmermeer een eigen bestuurscentrum in het centrum van Hoofddorp, dat bestond uit het raadhuis, het polderhuis, het kantongerecht en de korenbeurs. De Haarlemmermeerpolder fuseerde in 1979 met aantal kleine waterschappen tot Groot-Haarlemmermeer. Dit ging in 2005 op in het hoogheemraadschap van Rijnland. Voor het ontwerp van het polderhuis greep Foeke Kuipers (1871 – 1954) terug op het 17de-eeuws Hollands classicisme. Het vrijstaande pand bestaat uit twee bouwlagen en een kelder. Op de voorgevel een cartouche met bouwjaar, het gemeentewapen en de Nederlandse leeuw. Daarboven het wapen van het Waterschap Groot-Haarlemmermeer.  

Het Polderhuis is momenteel in gebruik als kantoorruimte en wordt verhuurd door het Hoogheemraadschap van Rijnland aan het bedrijfsbureau van Stichting Kinderopvang Haarlemmermeer (SKH). Sinds begin 2024 is SKH, de grootste kinderopvangorganisatie van de Haarlemmermeer, hier gevestigd. Vanaf 1 juni 2025 stelt zij de grote raadzaal op de eerste verdieping beschikbaar voor huwelijksceremonies en voor de verhuur ten behoeve van trainingen, workshops en vergaderingen.