De Keyserkerk is het oudste gebouw in UNESCO werelderfgoed Droogmakerij de Beemster. De Beemster is een innovatieve droogmakerij uit het begin van de 17e eeuw met een ordelijke en strak geometrische verkaveling. De rechte lijnen in het landschap zijn nu nog steeds goed te herkennen. Het is een uniek voorbeeld van een door de mens geschapen landschap. In 1999 kreeg de droogmakerij de UNESCO werelderfgoedstatus.

De bouw van de Keyserkerk is in 1618 gestart. Vijf jaar na de start werd de kerk ingewijd, en twee jaar later werd deze ook helemaal afgebouwd. Deze kerk is één van de vroegste voorbeelden van protestantse kerkbouw in Holland volgens het traditioneel lengtepatroon. Het is zaalkerk met westtoren, ontworpen door de architect H. de Keyser, H. Staets en C. Danckertsz. De torenbekroning is ontworpen door architect Pieter Post in 1661. Het mechanisch torenuurwerk is van Eijsbouts en voorzien van een elektrische opwinding.

In de loop der jaren is er uiteraard veel veranderd aan het uiterlijk van de kerk. Een prent uit 1727 laat de kerk zien in zijn uiteindelijke vorm, echter zonder de later aangebouwde stovenkamer. De zogeheten stovenkamer, is uniek in Nederland. Vroeger werd deze ruimte gebruikt om de stoven klaar te maken. De in het vuur gewarmde kooltjes werden in testjes in de stoven geplaatst en vóór de zitplaats van de eigenaar neergezet. Tevens konden verkleumde kerkgangers zich voor de dienst bij het haardvuur warmen. De stovenkamer is praktisch geheel voorzien van een 17e eeuwse wandbetegeling en heeft een originele open schouw.

De preekstoel en het doophek zijn uit de 17e eeuw. De kerkbanken, twee koperen lezenaars, doopbekkenhouder (met bekken), zandloperhouder (met zandloper) en doopboog zijn 18e eeuws. Epitaaf Tobias de Coene die is gestorven in 1617.
In de zerkenvloer zijn de zerken aanwezig van Johan van Reygersberg, gestorven in 1693, en diens vrouw Sara van Os, gestorven in 1703.
Het tweeklaviers orgel met vrij Pedaal is in 1908 gemaakt door fa L. van Dam en Zonen met gebruikmaking van materiaal van P. Flaes.

De rechthoekige zaalkerk met de hoge slanke toren aan de westzijde zorgen voor een heel herkenbaar en markant element in het landschap van de Beemster.