De Purmerkerk is ontworpen door de Amsterdamse architect Berend Tobias Boeyinga en naar een voorbeeld van een gereformeerde kerk in Egmond aan Zee. De kerk is in 1961 in gebruik genomen. Het gebouw heeft een strakke sobere vorm. De kerk is gebouwd volgens de Griekse kruisvorm. De eerste en laatste letter van het Griekse alfabet, alfa en omega, staan gebeiteld in de kolommen naast de kerkdeur en op de preekstoel.

De toren met luidklok is voorzien van koperbeslag. De uitsparingen in de hoeken van de kubusvormen geeft een speels karakter. Aan de buitenzijde is de plint van donkerrode baksteen met daarboven een witgepleisterde gevel. Karakteristiek zijn de beton-glasramen. Het plafond in de kerk is blauw/wit betimmerd en het interieur in licht eiken. Bijzonder is de uitbouw in de buitenmuur, waarin de kansel is geplaatst.

De kerk is gebouwd op de oude fundamenten van de kerk op dezelfde locatie die na restauratiewerkzaamheden in 1959 is afgebrand.

De voormalige pastorie naast de kerk is een rijksmonument, gebouwd in 1865 in eclectische trant door architect P.J. Hamer uit Amsterdam, tegelijk met de naastgelegen afgebrande kerk met toren. De pastorie ligt in de Purmerbuurt, bij het wegenkruis van de Westerweg en de Purmerenderweg en vormt het restant van de eerste kerkelijke stichting in polder De Purmer.