Het ontwerp van deze 150 jarige neogotische kerk is van architect Alfred Tepe (1840-1920), die voor de rooms-katholieke parochie van Mijdrecht en Wilnis een driebeukige hallenkerk tekende naar Westfaals model. De hoogte van de zijbeuken is daarbij vrijwel gelijk aan die van het middenschip. 

De uitwendige vorm van het gebouw is echter die van een kruisbasiliek. Door deze uitzonderlijke combinatie van hallenkerk en kruisbasiliek neemt dit monumentale gebouw een unieke plaats in binnen het werk van architect Tepe. Maar liefst 70 neogotische kerken heeft hij op zijn naam gebracht, waaronder de naburige katholieke kerken van Vinkeveen en Abcoude. 

De kerk werd gebouwd op het grondgebied van de toenmalige gemeente Wilnis. De eveneens door Tepe ontworpen neogotische pastorie, ook rijksmonument sinds 1976, kwam echter geheel op Mijdrechts grondgebied tot stand. De Wilnissers, die de meerderheid van de parochianen vormden, hebben zelfs nog tot 1939 een aparte ingang gehad op de plaats waar nu de Mariakapel in de kerk is. De huidige ingang onder de toren voor alle parochianen was tot die tijd uitsluitend bestemd voor de Mijdrechtse parochianen. 

Alfred Tepe was een prominent lid van het Utrechtse Sint Bernulphusgilde, een genootschap van geestelijken en kunstenaars die de neogotiek in de kerkbouw en kerkelijke kunst nastreefden. Naar middeleeuws idee werkte hij bij voorkeur samen met collega-kunstenaars van dat gilde, vooral met beeldhouwer-schilder Wilhelm Mengelberg, van wie prachtige interieurstukken nog in de kerk aanwezig zijn, met glazenier Heinrich Geuer, die hier de schitterende gebrandschilderde ramen voor maakte en met meester-edelsmid Gerard Brom en diens zoon Jan Brom, de scheppers van onder meer het doopvont. 

Met elkaar leverde deze groep kunstenaars, die ook bekend stond als het Utrechtse kwartet, met deze kerk een ‘Gesamtkunstwerk’ af. 

Het monumentale orgel uit 1879, recent gerestaureerd terug naar de originele staat, is van de Utrechtse orgelbouwer Michaël Maarschalkerweerd, die eveneens lid was van het Bernulphusgilde. Michaël en zijn vader Pieter Maarschalkerweerd waren dé orgelbouwers van katholiek Nederland met meer dan 170 orgels op hun naam maar ook van het Concertgebouw in Amsterdam.  

De kerk is goed toegankelijk voor rolstoelen en rollators. Iedereen is welkom, reserveren is niet nodig.